
Localizada no centro da Vila de Vagos, os primeiros estatutos conhecidos da Misericórdia em Vagos datam de 1694.
Nesta data existia uma capela da Misericórdia com irmandade, e na capela uma imagem de Nossa Senhora da Misericórdia. O culto da irmandade era feito ao Senhor dos Passos, realizando-se no quinto Domingo da Quaresma uma procissão dos Passos com acompanhamento musical. No século XIX, existiam ainda edifícios adstritos à Misericórdia, como uma albergaria onde poderá ter havido uma roda de expostos e dois celeiros, um mais antigo que o outro. Neste século foram demolidos para edificar a atual capela. Os modernos estatutos da irmandade da Misericórdia datam de 1876, continuando a haver uma irmandade do Senhor dos Passos ligada à capela com o mesmo nome.